[fix] ruff check の既存違反 299 件を解消し依存更新の検証スイートに組み込む ...

- ruff.toml の行長を 88 → 100 に緩和し，テンプレート管理の .claude/ を対象外に
- I001・F401 を自動修正，F841 と行長 100 超の E501 26 件を手で修正（挙動・出力文字列は不変）
- scripts をリポジトリ外 cwd から起動するスモークテスト test_script_entrypoints.py を追加
- coding-style.md の行長記述，ENV_04 の検証スイート（uv run ruff check . を追加），PROGRESS.md を更新

Refs #15

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[clean] testing.md の実行コマンドを ENV_04 への参照に置き換え重複を解消 ...

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[update] テンプレート新構成へ追従し規約の rules 化・開発コマンド整備・Dependabot 設定を追加 ...

- GUIDE_06〜09 を path-scoped rule（.claude/rules/coding-style / project-structure / testing / error-handling）へ移行し，CLAUDE.md とテストの docstring の参照を更新
- 開発コマンド一覧 ENV_04 を新設し，ENV_02 にフック実行の前提（bash）を追記
- .github/dependabot.yml（pip・github-actions，週 1）を追加し，ENV_03 に Dependabot 有効化手順を記載
- PROGRESS.md にテンプレート同期のエントリを追記

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[update] テンプレート最新版を同期し commands を skills へ移行・規約を .claude/rules へ再編 ...

- .claude/commands を .claude/skills へ移行し auto-audit・consult・deps-update・set-mode・task-*・verify を追加
- 旧 GUIDE_02〜05 を廃止し .claude/rules（git-conventions / markdown-style / docs-naming / progress-log / template-customization）と新 GUIDE_02 に再編
- advisor・deps-analyst・ops-runner・verifier エージェント，notify / run_python フックを追加
- CLAUDE.md の共通セクション・.gitignore をマージし，旧 GUIDE 参照を更新
- .claude/project-mode を solo で作成し template-sync-sha を更新

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