MedSegAgentWebApp / dataset /
@Haoyu Wang Haoyu Wang authored on 4 Jun 2025
GitHub committed on 4 Jun 2025
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AMOS22_Task2.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
ATM22.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
AbdomenAtlasMini.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
Adrenal-ACC-Ki67-Seg.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
AutoPET.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
BraTS21.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
CT-ORG.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
CrossMoDA2023.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
FLARE22.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
FUMPE.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
HECKTOR2022.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
ISLES22.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
ISLES22_ATLAS.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
ImageCAS.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
Instance22.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
KiTS23.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
LNQ2023.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
LiTS.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
MM-WHS.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
MMs.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
Parse22.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
README.md FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
SPPIN.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
SegRap2023_Task1.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
SegRap2023_Task2.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
TDSC-ABUS2023.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
TotalSegmentator_MRI.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
TotalSegmentator_v2.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
WORD.json FEAT: update MedSegAgent V1 Core (#1) 1 year ago
README.md

数据集 JSON 模板说明

在添加一个新的数据集时,需要按照以下 JSON 模板进行准备。请确保每个字段都正确填写,并遵循模板中的格式。

{
    "name": "dataset name",
    "description": "",
    "input_modalities": {
        "0": "modality1",
        "1": "modality2"
    },
    "labels": {
        "background": 0,
        "class1": 1,
        "class2": 2
    },
    "numTraining": 100,
    "file_ending": ".nii.gz",
    "models": {
        "nnV1": [
            "nnUNet",
            "STU-Net-S",
            "STU-Net-B",
            "STU-Net-L"
        ],
        "nnV2": [
            "nnUNet",
            "STU-Net-S",
            "STU-Net-B",
            "STU-Net-L"
        ],
        "monai": [
            "SwinUNETR",
            "UNETR"
        ]
    }
}

字段说明

  • name: 数据集的名称。

    • 类型: 字符串
    • 示例: "dataset name"
  • description: 数据集的描述。

    • 类型: 字符串
    • 示例: ""(可为空)
  • input_modalities: 输入模态的列表,每个模态对应一个键值对。

    • 类型: 对象
    • 示例:
      {
          "0": "modality1",
          "1": "modality2"
      }
      
  • labels: 标签列表,每个标签对应一个键值对,键为标签名称,值为标签的数字表示。

    • 类型: 对象
    • 示例:
      {
          "background": 0,
          "class1": 1,
          "class2": 2
      }
      
  • numTraining: 训练样本的数量。

    • 类型: 整数
    • 示例: 100
  • file_ending: 数据文件的后缀名。

    • 类型: 字符串
    • 示例: ".nii.gz"
  • models: 模型列表,每个模型框架包含多个模型名称。

    • 类型: 对象
    • 示例:
      {
          "nnV1": [
              "nnUNet",
              "STU-Net-S",
              "STU-Net-B",
              "STU-Net-L"
          ],
          "nnV2": [
              "nnUNet",
              "STU-Net-S",
              "STU-Net-B",
              "STU-Net-L"
          ],
          "monai": [
              "SwinUNETR",
              "UNETR"
          ]
      }