paths: ["src/", "scripts/", "tests/", "config/"]

ディレクトリ構造規則 (Directory Structure)

ファイルを新規作成・移動するときは本ルールの配置に従うこと．

プロジェクトルート (Project Root)

SmTIAS-Evaluation/
├── src/                   # ソースコード
│   ├── io/                # 画像の読み込み
│   ├── analysis/          # 解析ロジック
│   ├── visualization/     # 可視化
│   └── export/            # 結果出力
├── scripts/               # 実行スクリプト
├── config/                # 解析設定（ROI 定義 `roi_config.json` 等）
├── tests/                 # テストコード（`scripts/` のテストは `tests/scripts/`）
├── data/                  # 入力画像（Git 管理外）
├── output/                # 解析結果（Git 管理外）
└── docs/                  # ドキュメント

配置ルール (Placement Rules)

種類	配置先	備考
解析ロジック	`src/` 配下の該当パッケージ	1 モジュール = 1 責務
実行スクリプト	`scripts/`	CLI のエントリーポイント
テスト	`tests/`	`src/` の構造に対応させる
入力画像	`data/{装置名}/{撮影物}/`	例: `data/smtias/whiteboard/`
出力結果	`output/figures/`，`output/results/`	図は PNG，数値は CSV
設定ファイル	プロジェクトルート	`pyproject.toml`，`ruff.toml` 等

テストの対応関係 (Test Mapping)

tests/ は src/ のディレクトリ構造に対応させる．

src/analysis/uniformity.py  →  tests/analysis/test_uniformity.py
src/io/loader.py            →  tests/io/test_loader.py