diff --git a/.gitignore b/.gitignore
new file mode 100644
index 0000000..d49a554
--- /dev/null
+++ b/.gitignore
@@ -0,0 +1,29 @@
+# ビルド生成物
+build/
+
+# latexmk を使わずにビルドした場合の中間ファイル
+*.aux
+*.bbl
+*.bcf
+*.blg
+*.fdb_latexmk
+*.fls
+*.lof
+*.log
+*.lot
+*.out
+*.run.xml
+*.synctex.gz
+*.toc
+
+# 参考資料（他者の論文・個人情報を含むため管理しない）
+Reference/
+
+# Word の一時ファイル
+~$*
+
+# OS
+.DS_Store
+Thumbs.db
+Zone.Identifier
+*:Zone.Identifier
diff --git a/.latexmkrc b/.latexmkrc
new file mode 100644
index 0000000..671211d
--- /dev/null
+++ b/.latexmkrc
@@ -0,0 +1,7 @@
+# LuaLaTeX + biber でビルドし，生成物は build/ に出力する
+$pdf_mode = 4;  # lualatex
+$lualatex = 'lualatex -synctex=1 -interaction=nonstopmode -file-line-error %O %S';
+$bibtex_use = 2;  # biber
+$out_dir = 'build';
+$max_repeat = 10;  # 空の状態からだと目次・参照・文献の確定に6回程度かかる
+@default_files = ('main.tex');
diff --git a/.vscode/settings.json b/.vscode/settings.json
new file mode 100644
index 0000000..60685ae
--- /dev/null
+++ b/.vscode/settings.json
@@ -0,0 +1,22 @@
+{
+  // LaTeX Workshop: .latexmkrc の設定（LuaLaTeX + biber）でビルドする
+  // 既定のレシピは -pdf（pdfLaTeX）を付けてしまうため上書きする
+  "latex-workshop.latex.tools": [
+    {
+      "name": "latexmk",
+      "command": "latexmk",
+      "args": ["%DOC%"],
+      "env": {}
+    }
+  ],
+  "latex-workshop.latex.recipes": [
+    {
+      "name": "latexmk (LuaLaTeX)",
+      "tools": ["latexmk"]
+    }
+  ],
+  "latex-workshop.latex.rootFile.useSubFile": false,
+  "latex-workshop.latex.outDir": "%DIR%/build",
+  "latex-workshop.latex.autoClean.run": "never",
+  "latex-workshop.view.pdf.viewer": "tab"
+}
diff --git a/README.md b/README.md
index b385b13..54af14c 100644
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -1,2 +1,34 @@
 MasterThesis
 ===============
+
+修士論文（LuaLaTeX + jlreq，参考文献は biblatex + biber）
+
+## ビルド
+
+```sh
+latexmk        # build/main.pdf を生成
+latexmk -c     # 中間ファイルを削除
+```
+
+VS Code の LaTeX Workshop では，どの `.tex` を保存しても `main.tex` がビルドされる。
+
+## フォルダ構成
+
+| パス | 内容 |
+|---|---|
+| `main.tex` | 骨組み。章を `\include` で並べる |
+| `style/` | パッケージ (`preamble.tex`) と自作コマンド (`macros.tex`) |
+| `chapters/` | 1章 = 1ファイル |
+| `backmatter/` | 謝辞 |
+| `figures/<章名>/` | 図（グラフは PDF 推奨） |
+| `bib/references.bib` | 参考文献 |
+| `cover/` | 表紙・背表紙の PDF（配布後に配置） |
+| `notes/` | 章構成の検討メモ |
+
+## 書き方のルール
+
+- 章を追加するときは `chapters/<内容>.tex` を作り，`main.tex` に `\include` を足す
+- ラベルは `種類:章:内容`（例: `\label{fig:method:overview}`）で付け，`\figref{method:overview}` で参照する
+- 作業中の章だけビルドするときは `main.tex` の `\includeonly` を使う
+- 修正箇所は `\revised{}`，書きかけは `\todo{}`。提出時は `style/macros.tex` の `\showrevisiontrue` を `\showrevisionfalse` にする
+- 見本は `chapters/example.tex`（本文を書き始めたら削除）
diff --git a/backmatter/acknowledgments.tex b/backmatter/acknowledgments.tex
new file mode 100644
index 0000000..8c5746e
--- /dev/null
+++ b/backmatter/acknowledgments.tex
@@ -0,0 +1,3 @@
+% !TEX root = ../main.tex
+\chapter{謝辞}
+\todo{謝辞}
diff --git a/bib/references.bib b/bib/references.bib
new file mode 100644
index 0000000..1787737
--- /dev/null
+++ b/bib/references.bib
@@ -0,0 +1,12 @@
+% 参考文献データベース
+% キーは「第一著者の姓 + 年」を基本にする（例: kawaguchi2019）
+% Zotero 等からエクスポートしたものを貼り付けてもよい
+
+@article{kawaguchi2019,
+  author  = {Kawaguchi, Rui and Nakada, Taka-aki and Oshima, Taku and Shinozaki, Masayoshi and Nakaguchi, Toshiya and Haneishi, Hideaki and Oda, Shigeto},
+  title   = {Optimal pressing strength and time for capillary refilling time},
+  journal = {Critical Care},
+  volume  = {23},
+  pages   = {4},
+  year    = {2019},
+}
diff --git a/chapters/conclusion.tex b/chapters/conclusion.tex
new file mode 100644
index 0000000..ebd74ad
--- /dev/null
+++ b/chapters/conclusion.tex
@@ -0,0 +1,4 @@
+% !TEX root = ../main.tex
+\chapter{総論}
+\label{chap:conclusion}
+\todo{本研究のまとめと今後の課題}
diff --git a/chapters/example.tex b/chapters/example.tex
new file mode 100644
index 0000000..4f42abf
--- /dev/null
+++ b/chapters/example.tex
@@ -0,0 +1,66 @@
+% !TEX root = ../main.tex
+% 書き方の見本．本文を書き始めたら main.tex の \include と一緒に削除する
+\chapter{書き方の見本}
+\label{chap:example}
+
+\section{図}
+\label{sec:example:figure}
+図は figures/<章名>/ に置き，拡張子を省略して読み込む．
+グラフは PDF で書き出すと拡大しても劣化しない．
+\figref{example:single}に単一の図，\figref{example:sub}に小図を並べた例を示す．
+
+\begin{figure}[H]
+  \centering
+  % 実際には \includegraphics[width=0.6\linewidth]{example/overview} のように書く
+  \includegraphics[width=0.5\linewidth]{example-image}
+  \caption{単一の図の例}
+  \label{fig:example:single}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[H]
+  \centering
+  \begin{subfigure}[b]{0.45\linewidth}
+    \centering
+    \includegraphics[width=\linewidth]{example-image-a}
+    \caption{条件A}
+    \label{fig:example:sub-a}
+  \end{subfigure}
+  \hfill
+  \begin{subfigure}[b]{0.45\linewidth}
+    \centering
+    \includegraphics[width=\linewidth]{example-image-b}
+    \caption{条件B}
+    \label{fig:example:sub-b}
+  \end{subfigure}
+  \caption{小図を並べた例}
+  \label{fig:example:sub}
+\end{figure}
+
+\section{表}
+\label{sec:example:table}
+表は booktabs を使い，縦罫線は引かない．\tabref{example:result}に例を示す．
+
+\begin{table}[H]
+  \centering
+  \caption{表の例}
+  \label{tab:example:result}
+  \begin{tabular}{lSS}
+    \toprule
+    被験者 & {閾値} & {AUC} \\
+    \midrule
+    被験者1 & 1.23  & 0.658 \\
+    被験者2 & 0.0699 & 0.686 \\
+    \bottomrule
+  \end{tabular}
+\end{table}
+
+\section{数式・単位・引用}
+\label{sec:example:math}
+数式は align などを使う（eqnarray は使わない）．\equref{example:exp}に例を示す．
+\begin{align}
+  \hat{G}(t) = y_0 + A \left(1 - e^{-t/\tau}\right)
+  \label{eq:example:exp}
+\end{align}
+単位は siunitx で \SI{3}{N}，\SI{30}{fps} のように書く．
+文献は bib/references.bib に登録し，キーで引用する\cite{kawaguchi2019}．
+修正した箇所は\revised{このように強調}でき，提出時に一括で解除できる．
diff --git a/chapters/introduction.tex b/chapters/introduction.tex
new file mode 100644
index 0000000..a823bb1
--- /dev/null
+++ b/chapters/introduction.tex
@@ -0,0 +1,23 @@
+% !TEX root = ../main.tex
+\chapter{序論}
+\label{chap:intro}
+
+\section{研究背景}
+\label{sec:intro:background}
+\todo{研究背景}
+
+\section{先行研究}
+\label{sec:intro:related}
+\todo{先行研究}
+
+\section{研究目的}
+\label{sec:intro:purpose}
+\todo{研究目的}
+
+\section{本論文の構成}
+\label{sec:intro:structure}
+本論文の構成を以下に示す．
+
+\chapref{intro}では研究背景，先行研究と目的について述べた．
+
+\chapref{conclusion}では本論文の結論について述べる．
diff --git a/cover/.gitkeep b/cover/.gitkeep
new file mode 100644
index 0000000..e69de29
--- /dev/null
+++ b/cover/.gitkeep
diff --git a/figures/conclusion/.gitkeep b/figures/conclusion/.gitkeep
new file mode 100644
index 0000000..e69de29
--- /dev/null
+++ b/figures/conclusion/.gitkeep
diff --git a/figures/example/.gitkeep b/figures/example/.gitkeep
new file mode 100644
index 0000000..e69de29
--- /dev/null
+++ b/figures/example/.gitkeep
diff --git a/figures/introduction/.gitkeep b/figures/introduction/.gitkeep
new file mode 100644
index 0000000..e69de29
--- /dev/null
+++ b/figures/introduction/.gitkeep
diff --git a/main.tex b/main.tex
new file mode 100644
index 0000000..985351a
--- /dev/null
+++ b/main.tex
@@ -0,0 +1,55 @@
+% 修士論文 メインファイル
+% ビルド: latexmk（設定は .latexmkrc，LuaLaTeX + biber，出力は build/）
+% 本文はここに書かず，章ごとのファイルを \include で読み込む
+
+% 見出しのゴシック体を先輩と同じ太さ（Regular）にする．
+% jlreq がクラス内で luatexja を読み込むため，\documentclass より前に指定する
+\makeatletter
+\def\ltj@stdgtfont{file:HaranoAjiGothic-Regular.otf}
+\makeatother
+
+\documentclass[
+  book,
+  paper=a4paper,
+  fontsize=11pt,
+  % 先輩（pLaTeX + jreport 11pt）に合わせる: 和文は欧文の0.962倍，行送り15.5pt
+  jafontscale=0.962,
+  baselineskip=15.5pt,
+  oneside,  % 片面印刷（両面にするなら twoside, openright）
+  openany,
+  % 余白は先輩の設定に合わせた（上25.4 / 下35.4 / 左右19.05 mm）．指定が配布されたら変更する
+  head_space=25.4mm,
+  foot_space=35.4mm,
+  gutter=19.05mm,
+  fore-edge=19.05mm,
+]{jlreq}
+
+\input{style/preamble}
+\input{style/macros}
+
+% 作業中の章だけビルドしたいときに有効化（ページ番号・相互参照は保持される）
+% \includeonly{chapters/introduction}
+
+\begin{document}
+
+% 表紙（配布されたら cover/ に置いて有効化）
+% \includepdf[pages=-]{cover/frontCover.pdf}
+
+\frontmatter
+\tableofcontents
+% \listoffigures
+% \listoftables
+
+\mainmatter
+\include{chapters/introduction}
+\include{chapters/example}  % 書き方の見本．本文を書き始めたら削除する
+\include{chapters/conclusion}
+
+\backmatter
+\include{backmatter/acknowledgments}
+\printbibliography[heading=bibintoc, title=参考文献]
+
+% 背表紙（配布されたら cover/ に置いて有効化）
+% \includepdf[pages=-]{cover/backCover.pdf}
+
+\end{document}
diff --git a/notes/outline.md b/notes/outline.md
new file mode 100644
index 0000000..da785a9
--- /dev/null
+++ b/notes/outline.md
@@ -0,0 +1,15 @@
+# 章構成メモ
+
+構成が固まるまでここで検討し，決まったら `chapters/` にファイルを追加して `main.tex` に `\include` を足す。
+
+## 仮の章立て
+
+1. 序論（`introduction.tex`）: 研究背景 / 先行研究 / 研究目的 / 本論文の構成
+2. （研究の章: 未定）: はじめに / 実験方法 / 結果と考察 / 小括
+3. 総論（`conclusion.tex`）
+
+## ルール
+
+- ファイル名は章番号ではなく内容で付ける（例: `method.tex`）。順番は `main.tex` で決める
+- 図は `figures/<ファイル名と同じ章名>/` に置く
+- ラベルは `種類:章:内容`（例: `fig:method:overview`）
diff --git a/style/macros.tex b/style/macros.tex
new file mode 100644
index 0000000..6c5f6d5
--- /dev/null
+++ b/style/macros.tex
@@ -0,0 +1,20 @@
+% 自作コマンド（main.tex から \input される）
+
+% ---- 参照 ----
+% ラベルは「種類:章:内容」で付ける．例: \label{fig:intro:overview}
+% 本文では \figref{intro:overview} → 「図1.1」
+\newcommand{\figref}[1]{図\ref{fig:#1}}
+\newcommand{\tabref}[1]{表\ref{tab:#1}}
+\newcommand{\equref}[1]{式(\ref{eq:#1})}
+\newcommand{\chapref}[1]{第\ref{chap:#1}章}
+\newcommand{\secref}[1]{\ref{sec:#1}節}
+
+% ---- 執筆中の補助 ----
+% \showrevisionfalse にすると，修正箇所の色付けと TODO がすべて消える（提出時）
+\newif\ifshowrevision
+\showrevisiontrue
+
+% 修正箇所: \revised{修正した文}
+\newcommand{\revised}[1]{\ifshowrevision{\color{red}#1}\else#1\fi}
+% 書きかけ: \todo{実験条件を追記}
+\newcommand{\todo}[1]{\ifshowrevision{\color{blue}[TODO: #1]}\fi}
diff --git a/style/preamble.tex b/style/preamble.tex
new file mode 100644
index 0000000..d3c01f7
--- /dev/null
+++ b/style/preamble.tex
@@ -0,0 +1,41 @@
+% パッケージの読み込み（main.tex から \input される）
+% 日本語処理（luatexja）は jlreq が LuaLaTeX 上で自動的に読み込む
+
+% 数式とフォント（欧文・数式は Palatino 系．先輩の mathpazo に合わせる）
+\usepackage{amsmath}
+\usepackage{newpxtext, newpxmath}  % amssymb の記号も含む
+\usepackage{bm}
+
+% 見出し（先輩の jreport に合わせ，ゴシック + 欧文 Palatino 太字）
+\ModifyHeading{chapter}{font={\huge\bfseries}}
+\ModifyHeading{section}{font={\Large\bfseries}}
+\ModifyHeading{subsection}{font={\large\bfseries}}
+\ModifyHeading{subsubsection}{font={\normalsize\bfseries}}
+
+% 図表
+\usepackage{graphicx}
+\graphicspath{{figures/}}
+\usepackage{float}          % [H] で位置を固定
+\usepackage{subcaption}     % 小図 (a)(b)
+\captionsetup{format=hang, font=small, labelfont=bf}  % 先輩の caption[hang,small,bf] と同じ
+\usepackage{booktabs}       % 表の罫線
+\usepackage{multirow}
+\usepackage{siunitx}        % 数値と単位: \SI{3}{N}, \num{0.84}
+
+% PDF の差し込み（表紙・背表紙）
+\usepackage{pdfpages}
+
+% 色（修正箇所の強調・TODO）
+\usepackage{xcolor}
+
+% 参考文献（bib/references.bib を biber で処理，引用順の番号）
+\usepackage[backend=biber, style=ieee]{biblatex}
+\addbibresource{bib/references.bib}
+\setlength{\biblabelsep}{0.5em}  % jlreq では番号 [1] と本文の間が詰まるため
+
+% URL とリンク（hyperref はなるべく最後に読み込む）
+\usepackage{url}
+\usepackage[
+  hidelinks,
+  bookmarksnumbered=true,
+]{hyperref}