[update] リファクタリング完了に伴う進捗ドキュメントを更新

[update] テンプレートを最新化（エージェントチーム・コマンド・GUIDE_05 を追加） ...

- .claude/agents（coder/refactorer/tester）と .claude/commands（commit/implement/setup）を追加
- restrict_repo_access.py フック・settings.json・template-sync-sha を追加
- GUIDE_05 エージェント運用ルール・docs/PROGRESS.md・.gitattributes を追加
- CLAUDE.md と GUIDE_01 を共通ルール更新に追従（進捗二段構成・/commit 運用・05_TECH/06_TEST）
- .gitignore に .claude/commit-context.md を追記（固有ルールは保持）

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>