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TIASDataHub / docs / PROGRESS.md

開発進捗ログ

  •  プロジェクト立ち上げ(GUIDE_01): 要件定義・技術選定・環境構築・仕様設計・規約整備・開発計画を chore/project-setup で完了(2026-10-02).solo モード
    • 動機: 舌診研究の各リポジトリが研究室 PC のフォルダを個別に読む形をやめ,データセット名と版で取り出せる共通の入口を作る
    • 設計判断: 目録は SQLite + SHA-256 名のストア(取り込み時にコピー.原本参照より版の再現が確実).計算サーバへは版ごとのバンドル(SHA256SUMS 付き)を直送.所見は種類の定義+ JSON 値で持ち,種類の追加で表を作り直さない
    • 運用: 研究室 PC は手元 PC から ssh labpc で操作し,研究室 PC では編集しない.研究室 PC に uv 0.12.22・Python 3.12.15 を導入済み.検証プロファイルは作らない(CLI はテストと tiasdata check で確認する)
    • 未実装・後段: main がまだ存在しない(GitHub・GitBucket とも空).取り込み後に研究室 PC へ clone する(ENV_02).次は PLAN_02 Step 1
  •  舌色データが 1 患者 1 枚でないことの反映: 研究室 PC の対応表(DeepTIAS後_ID_番号.xlsx)と件数だけで照合し,1085 枚が約 450 人分(2 枚以上の患者 239 人・874 枚)と判明(2026-10-03).取り込みで対応表を読み,患者単位で症例をまとめる設計に直した(PLAN_01・PLAN_02・SPEC_01〜03・ENV_01)
    • 影響: TIASJudgeModel は画像 ID を patient_id にしており,同じ患者の画像が学習と評価に分かれている可能性がある.基盤経由に切り替える Step 8 で患者単位の分割に直し,成績の差を記録する
    • 判断: xlsx を読む openpyxl は任意の依存(import)にし,使う側には入れない
  •  研究室 PC の DeepTIAS 出力の整理: 空き容量の不足(1.09 GB)を受け,舌色データセットで使った画像の DeepTIAS 出力だけを番号ごとのフォルダ DeepTIAS_TIASJudgeModel\<番号>\ へ移し(同じドライブ内の移動.約 40.6 GB),使わない出力(約 8.1 GB)を削除した(2026-10-03.空き 9.5 GB).元のデータは研究室のサーバにある
    • 方法: 対応表の xlsx(番号・何枚目・患者 ID)で引き,2-cropped × 3-resized の作り直しが舌色データセットの画像と画素で一致するかで確認.対応表どおりで引けない 192 件(撮影日等の下位フォルダ・ID と合わないフォルダ名・何枚目の誤り等)は画素の一致で探して全件特定した.Claude は件数だけを見て,番号以外の名前・患者 ID は表示していない.移動・削除はユーザーが実行
    • 設計判断: 名前の規則を推測せず画素の一致を正とした(対応表の誤り 29 件を含めて確実に特定できるため).LabImg × 4-mask は撮影画像全体の大きさで,データセットの画像(枠の大きさ)とは一致しない
    • 発見: 同じ写真の重複が 5 組(PLAN_01「現在あるデータ」).うち 2 組はラベルが違う.取り込み(Step 3)までに扱いを決める
  •  研究室 PC の臨床データを E ドライブへ移した: 研究室 PC に E ドライブ(内蔵 SSD・約 465GB)ができたため,C:\Users\Papin\clinical-data\ 全体(26,268 ファイル・45.30GB)を E:\clinical-data\ へコピーし,SHA-256 と構成の照合の後に C 側を削除した(2026-10-06.C の空き 53.5GB).docs・.claude/repo-access.json・lab-pc-operation.md のパスを書き換えた
    • 失敗パターン: C 側の削除が読み取り専用の属性が付いたフォルダで止まった(shutil.rmtree の WinError 5).属性を外して再試行する onexc で解決.コピー済み・照合済みだったためデータの欠損は無し
    • 未実装・後段: TIASJudgeModel の手順書の原本のパスが古い.E ドライブの暗号化(BitLocker)は未定(ENV_03「人間が確認すべき事項」)