[update] パッケージ管理を pip + venv から uv へ移行しバージョンを lock で固定 ...

- 依存を pyproject.toml に一本化（開発用は [dependency-groups] dev）し requirements*.txt を廃止
- uv.lock と .python-version（3.12）を追加し，解析結果の再現性のため全依存のバージョンを固定
- dependabot.yml の ecosystem を pip から uv に変更
- ENV_01〜04・README・SPEC_02 のコマンドを uv run 版に更新し，ENV_04 に依存更新の検証スイート（uv sync + uv run pytest）を定義
- PROGRESS.md に移行の経緯を追記

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