[update] docs整理: ENV_01内容修正，ディレクトリ構造分離，フォルダ・ファイル番号再編成 ...

- ENV_01: 実態に合わせて技術スタック修正（Preact→React 18，Custom Binary削除，Vitest削除，physics.ts参照修正）
- ENV_01からsrc/詳細構造を分離し，ENV_02_ディレクトリ構造.txtを新規作成
- ENV_07: load-bot.mjs→load-bot.tsに修正
- ENVファイル番号を参照頻度順に再編成（01技術スタック→02構造→03管理者→04構築→...→09TS概要）
- docsフォルダ名を大文字に統一し，GUIDE→ENVの順に変更（01_GUIDE, 02_ENV, 03_PLAN, 04_SPEC）
- CLAUDE.md, copilot-instructions, settings.jsonの参照パスを一括修正

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>

[add] GitHub Copilot用の共通指示ファイルを追加 ...

[add] コードコメント・ドキュメント規則に関する指示ファイルを追加
[add] プロトコル追加手順に関する指示ファイルを追加
[add] VSCode設定ファイルを追加